Kanabinoidy tvoria skupinu zlúčenín v chemickej superrodine terpénov. Terpény sú v podstate násobky stavebného bloku nazývaného izoprén. Dve izoprénové jednotky tvoria monoterpény, ktoré poznáme najlepšie ako éterické oleje, ako napríklad mentol. Štyri izoprénové jednotky tvoria diterpény, ako sú kanabinoidy alebo vitamín A. Triterpény tvoria stavebné kamene pre cholesterol, pohlavné a stresové hormóny. Pridaním ďalších izoprénových jednotiek sa zvýši tuhosť, až kým sa nakoniec nevytvorí poly-izoprén alebo latex.

Všetky rastlinné kanabinoidy pochádzajú z izoprénových jednotiek, zatiaľ čo živočíšne alebo endokanabinoidy sú odvodené od diacylglycerolu (DAG), ktorý je tiež zodpovedný za väčšinu mastných kyselín, ktoré tvoria naše bunkové membrány.